Genbank

GenBank
Περιεχόμενο
Περιγραφή	Αλληλουχίες νουκλεοτιδίων για περισσότερους από 300.000 οργανισμούς με υποστηρικτικό βιβλιογραφικό και βιολογικό σχολιασμό.
Οργανισμοί	Όλοι
Επαφή
Ερευνητικό κέντρο	NCBI
Πρώτη αναφορά	PubMed
Πρόσβαση
Μορφή δεδομένων	XML; ASN.1; Genbank format;
Ιστοσελίδα	NCBI
URL λήψης	ncbi ftp
URL υπηρεσίας ιστού	eutils; soap;
Εργαλεία
Διαδικτυακή εφαρμογή	BLAST
Διάφορα
Άδεια	Ασαφής:Η σελίδα λήψης στο UCSC αναφέρει "Το NCBI δεν θέτει περιορισμούς στη χρήση ή τη διανομή των δεδομένων GenBank. Ωστόσο, ορισμένοι υποβάλλοντες ενδέχεται να διεκδικήσουν διπλώματα ευρεσιτεχνίας, πνευματικά δικαιώματα ή άλλα δικαιώματα πνευματικής ιδιοκτησίας για όλα ή μέρος των δεδομένων που έχουν υποβάλει. Το NCBI είναι δεν είναι σε θέση να αξιολογήσει την εγκυρότητα τέτοιων αξιώσεων και επομένως δεν μπορεί να παρέχει σχόλια ή απεριόριστη άδεια σχετικά με τη χρήση, την αντιγραφή ή τη διανομή των πληροφοριών που περιέχονται στη GenBank."
Έκδοση	1982

Η βάση δεδομένων αλληλουχιών GenBank είναι μια συλλογή ανοιχτής πρόσβασης, με σχολιασμό όλων των διαθέσιμων στο κοινό αλληλουχιών νουκλεοτιδίων και των πρωτεϊνικών τους μεταφράσεων. Παράγεται και διατηρείται από το Εθνικό Κέντρο Πληροφοριών Βιοτεχνολογίας (NCBI, μέρος των Εθνικών Ινστιτούτων Υγείας στις Ηνωμένες Πολιτείες) ως μέρος της Διεθνούς Συνεργασίας Βάσεων Δεδομένων Ακολουθιών Νουκλεοτιδίων (INSDC).

Η GenBank και οι συνεργάτες της λαμβάνουν αλληλουχίες που παράγονται σε εργαστήρια σε όλο τον κόσμο από περισσότερους από 100.000 διαφορετικούς οργανισμούς. Η βάση δεδομένων ξεκίνησε το 1982 από το Εθνικό Εργαστήριο Walter Goad και Los Alamos. Η GenBank έχει γίνει μια σημαντική βάση δεδομένων για την έρευνα σε βιολογικά πεδία και έχει αναπτυχθεί τα τελευταία χρόνια με εκθετικό ρυθμό διπλασιαζόμενος περίπου κάθε 18 μήνες.^[1]^[2]

Το Release 242.0, που δημιουργήθηκε τον Φεβρουάριο του 2021, περιείχε πάνω από 12 τρισεκατομμύρια νουκλεοτιδικές βάσεις σε περισσότερες από 2 δισεκατομμύρια αλληλουχίες.^[3] Η GenBank δημιουργείται με άμεσες υποβολές από μεμονωμένα εργαστήρια, καθώς και από μαζικές υποβολές από μεγάλης κλίμακας κέντρα αλληλουχίας.

↑ Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Wheeler, David L. (2008-01). «GenBank». Nucleic Acids Research 36 (Database issue): D25–30. doi:10.1093/nar/gkm929. ISSN 1362-4962. PMID 18073190. PMC 2238942. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18073190.
↑ Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Sayers, Eric W. (2009-01). «GenBank». Nucleic Acids Research 37 (Database issue): D26–31. doi:10.1093/nar/gkn723. ISSN 1362-4962. PMID 18940867. PMC 2686462. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18940867.
↑ «GenBank release notes».

[1] Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Wheeler, David L. (2008-01). «GenBank». Nucleic Acids Research 36 (Database issue): D25–30. doi:10.1093/nar/gkm929. ISSN 1362-4962. PMID 18073190. PMC 2238942. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18073190.

[2] Benson, Dennis A.; Karsch-Mizrachi, Ilene; Lipman, David J.; Ostell, James; Sayers, Eric W. (2009-01). «GenBank». Nucleic Acids Research 37 (Database issue): D26–31. doi:10.1093/nar/gkn723. ISSN 1362-4962. PMID 18940867. PMC 2686462. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18940867.

[:0-3] «GenBank release notes».

[1]

[2]

[3]