Basic Local Alignment Search Tool

BLAST

Description de l'image CCDC132 Blast Results.png.
Informations
Développé par Altschul S.F., Gish W., Miller E.W., Lipman D.J., NCBI
Dernière version 2.9.0+ ()
Écrit en C++ et CVoir et modifier les données sur Wikidata
Système d'exploitation Type Unix, Linux, macOS et Microsoft WindowsVoir et modifier les données sur Wikidata
Environnement Multiplate-forme
Formats lus XML BLAST Output (d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Formats écrits XML BLAST Output (d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Type Outil bioinformatique
Licence Domaine public
Site web blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

BLAST (acronyme de basic local alignment search tool) est une méthode de recherche heuristique utilisée en bioinformatique. Il permet de trouver les régions similaires entre deux ou plusieurs séquences de nucléotides ou d'acides aminés, et de réaliser un alignement de ces régions homologues.

Étant donné une séquence introduite par l'utilisateur, BLAST permet de retrouver rapidement dans des bases de données, les séquences répertoriées ayant des zones de similitude avec la séquence d'entrée[1]. Cette méthode est utilisée pour trouver des relations fonctionnelles ou évolutives entre les séquences et peut aider à identifier les membres d'une même famille de gènes.

  1. Greg Gibson, Spencer V. Muse, Lionel Domenjoud, Raymond Cunin (trad. Lionel Domenjoud), Précis de génomique, Bruxelles/Paris, De Boeck Université, , 347 p. (ISBN 2-8041-4334-1), « 2 »

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