Varian yang diwaspadai

Varian yang diwaspadai atau istilah variant of concern (VOC) untuk Koronavirus sindrom pernapasan akut berat 2 (SARS-CoV-2, yang menyebabkan COVID-19) merupakan kategori yang digunakan ketika adanya mutasi pada Domain Pengikatan Reseptor (Receptor Binding Domain (RBD)) secara substansial mengalami peningkatan afinitas pengikatan (misalnya, N501Y) dalam RBD-hACE2 kompleks (data genetik), juga dikaitkan dengan penyebarannya yang cepat terhadap manusia (data epidemiologis).^[1]

Sebelum istilah ini muncul, varian yang baru biasanya diberi label "varian yang diminati" (variant of interest). Selama atau setelah masa penilaian yang lebih lengkap merupakan "varian yang diwaspadai", varian tersebut biasanya ditetapkan ke garis keturunan dalam sistem nomenklatur PANGOLIN^[2] dan ke clades di Nextstrain^[3] dan sistem GISAID.^[4]

Selama terjadinya pandemi COVID-19, virus SARS-CoV-2 telah mengalami mutasi, dengan spesifik kombinasi tertentu mutasi titik terbukti menjadi lebih memprihatinkan daripada hal lainnya. Mutasi ini terjadi terutama karena alasan penularan dan virulensi, dan juga berkaitan dengan kemungkinan adanya kemunculan mutasi pelepasan antigenik.

1. ^ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (Mei 2021). "Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern". Microorganisms (dalam bahasa Inggris). 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926 . 
2. ^ Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; et al. (2020). "A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 5 (11): 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5 . PMC 7610519 . PMID 32669681.  Parameter |s2cid= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)
3. ^ Bedford, Trevor; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A (6 January 2021). "Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy". nextstrain.org/blog. Diakses tanggal 18 Agustus 2021. 
4. ^ "clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')". www.gisaid.org. 4 Juli 2020. Diakses tanggal 18 Agustus 2021.