L’endosymbiose est une forme de symbiose entre deux organismes vivants, où l'un est contenu par l'autre. L'organisme interne est appelé un endosymbiote ou endosymbionte[1]. Cette terminologie est surtout employée au niveau cellulaire pour imager une coopération entre des micro-organismes simples, et les cellules d'organismes plus évolués qui les contiennent et dont ils favorisent le fonctionnement.
Lorsque l'organisme interne a un mode de vie intracellulaire, les écologues parlent d'endocytobiose ou endosymbiose intracellulaire, l'organisme étant un endocytobiote. Ils distinguent l'endosymbiose primaire quand un eucaryote phagocyte un procaryote vivant et l'endosymbiose secondaire lorsqu'un eucaryote phagocyte un autre eucaryote possédant déjà un endosymbionte[2]. À la suite d'une longue période d'intégration, les fusions symbiotiques intracellulaires conduisent à la création d'une véritable chimère génétique selon la théorie endosymbiotique[3].
La diversité des endosymbioses selon leur degré de passage et d'intrication répond ainsi à toute une hiérarchie : endosymbiose facultative ou obligatoire au moins pour l'un des deux partenaires, ectosymbiose, mésosymbiose, endosymbiose, endocytobiose[4].
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