Myxococcales

Classification
Domaine	Bacteria
Embranchement	Proteobacteria
Classe	Deltaproteobacteria

Les Myxococcales, ou Myxobacteria ou Myxobactéries, sont un ordre de bactéries que l'on trouve en majorité dans le sol et qui se nourrissent de composés organiques insolubles. Elles font partie de la classe des Deltaproteobacteria, un grand taxon de bactéries à Gram négatif.

La plupart des myxobactéries connues se distinguent par un cycle de vie complexe, et notamment la formation d'un corps de fructification pluricellulaire. Les classifications phylogénétiques moléculaires établies à partir de l'ARNr 16S montrent une monophylie des taxons constitués à partir de la morphologie des corps de fructification, suggérant que la forme et la taille de ces corps est un bon critère taxinomique^[2].

Les myxobactéries possèdent des génomes de très grande taille par rapport aux autres groupes de bactéries, à savoir de l'ordre de 9 à 10 millions de nucléotides, exceptions faites des genres Anaeromyxobacter^[3] et Vulgatibacter^[4]. En effet, les deux espèces de bactéries possédant les plus grands génomes connus sont des myxobactéries : Minicystis rosea (16 Mb)^[5] et Sorangium cellulosum^[6]^,^[7].

Les myxobactéries peuvent se déplacer par glissement. Typiquement, elles se déplacent en essaims (swarms en anglais) contenant de nombreuses cellules restant groupées ensemble grâce à des signaux moléculaires intercellulaires. Les individus bénéficient de cette agrégation car elle permet d'accumuler des enzymes extracellulaires utilisées pour digérer de la nourriture, ce qui en retour augmente l'efficacité d'alimentation. Les myxobactéries produisent un certain nombre de substances chimiques utiles en sciences biomédicales et dans l'industrie, tels que des antibiotiques, et exportent ces molécules dans le milieu extracellulaire^[8].

↑ Yao-Tseng Tchan, Jacques Pochon et André-Romain Prévot, « Étude de systématique bactérienne. VIII. Essai de classification des Cytophaga », Annales de l’Institut Pasteur (Paris), vol. 74,‎ 1948, p. 394-400.
↑ (en) De-Ming Jiang, Zhi-Hong Wu, Jing-Yi Zhao et Yue-Zhong Li, « Fruiting and non-fruiting myxobacteria: A phylogenetic perspective of cultured and uncultured members of this group », Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 44, n^o 2,‎ août 2007, p. 545-552 (ISSN 1055-7903, DOI 10.1016/j.ympev.2007.04.004, résumé)
↑ Sara H. Thomas, Ryan D. Wagner, Adrian K. Arakaki et Jeffrey Skolnick, « The mosaic genome of Anaeromyxobacter dehalogenans strain 2CP-C suggests an aerobic common ancestor to the delta-proteobacteria », PloS One, vol. 3, n^o 5,‎ 7 mai 2008, e2103 (ISSN 1932-6203, PMID 18461135, PMCID PMC2330069, DOI 10.1371/journal.pone.0002103, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)
↑ Eisaku Yamamoto, Hideyuki Muramatsu et Koji Nagai, « Vulgatibacter incomptus gen. nov., sp. nov. and Labilithrix luteola gen. nov., sp. nov., two myxobacteria isolated from soil in Yakushima Island, and the description of Vulgatibacteraceae fam. nov., Labilitrichaceae fam. nov. and Anaeromyxobacteraceae fam. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 64, n^o 10,‎ 2014, p. 3360–3368 (DOI 10.1099/ijs.0.063198-0, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)
↑ Ronald Garcia, Katja Gemperlein et Rolf Müller, « Minicystis rosea gen. nov., sp. nov., a polyunsaturated fatty acid-rich and steroid-producing soil myxobacterium », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 64, n^o 11,‎ 2014, p. 3733–3742 (DOI 10.1099/ijs.0.068270-0, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)
↑ Susanne Schneiker, Olena Perlova, Olaf Kaiser et Klaus Gerth, « Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum », Nature Biotechnology, vol. 25, n^o 11,‎ novembre 2007, p. 1281–1289 (ISSN 1087-0156, PMID 17965706, DOI 10.1038/nbt1354, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)
↑ (en) Miriam Land, Loren Hauser, Se-Ran Jun et Intawat Nookaew, « Insights from 20 years of bacterial genome sequencing », Functional & Integrative Genomics, vol. 15, n^o 2,‎ 1^er mars 2015, p. 141–161 (ISSN 1438-793X et 1438-7948, PMID 25722247, PMCID PMC4361730, DOI 10.1007/s10142-015-0433-4, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)
↑ H. Reichenbach, « Myxobacteria, producers of novel bioactive substances », Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, vol. 27, n^o 3,‎ septembre 2001, p. 149–156 (ISSN 1367-5435, PMID 11780785, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)

[1] Yao-Tseng Tchan, Jacques Pochon et André-Romain Prévot, « Étude de systématique bactérienne. VIII. Essai de classification des Cytophaga », Annales de l’Institut Pasteur (Paris), vol. 74,‎ 1948, p. 394-400.

[Jiang2007-2] (en) De-Ming Jiang, Zhi-Hong Wu, Jing-Yi Zhao et Yue-Zhong Li, « Fruiting and non-fruiting myxobacteria: A phylogenetic perspective of cultured and uncultured members of this group », Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 44, n^o 2,‎ août 2007, p. 545-552 (ISSN 1055-7903, DOI 10.1016/j.ympev.2007.04.004, résumé)

[3] Sara H. Thomas, Ryan D. Wagner, Adrian K. Arakaki et Jeffrey Skolnick, « The mosaic genome of Anaeromyxobacter dehalogenans strain 2CP-C suggests an aerobic common ancestor to the delta-proteobacteria », PloS One, vol. 3, n^o 5,‎ 7 mai 2008, e2103 (ISSN 1932-6203, PMID 18461135, PMCID PMC2330069, DOI 10.1371/journal.pone.0002103, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)

[4] Eisaku Yamamoto, Hideyuki Muramatsu et Koji Nagai, « Vulgatibacter incomptus gen. nov., sp. nov. and Labilithrix luteola gen. nov., sp. nov., two myxobacteria isolated from soil in Yakushima Island, and the description of Vulgatibacteraceae fam. nov., Labilitrichaceae fam. nov. and Anaeromyxobacteraceae fam. nov. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 64, n^o 10,‎ 2014, p. 3360–3368 (DOI 10.1099/ijs.0.063198-0, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)

[5] Ronald Garcia, Katja Gemperlein et Rolf Müller, « Minicystis rosea gen. nov., sp. nov., a polyunsaturated fatty acid-rich and steroid-producing soil myxobacterium », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 64, n^o 11,‎ 2014, p. 3733–3742 (DOI 10.1099/ijs.0.068270-0, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)

[6] Susanne Schneiker, Olena Perlova, Olaf Kaiser et Klaus Gerth, « Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum », Nature Biotechnology, vol. 25, n^o 11,‎ novembre 2007, p. 1281–1289 (ISSN 1087-0156, PMID 17965706, DOI 10.1038/nbt1354, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)

[7] (en) Miriam Land, Loren Hauser, Se-Ran Jun et Intawat Nookaew, « Insights from 20 years of bacterial genome sequencing », Functional & Integrative Genomics, vol. 15, n^o 2,‎ 1^er mars 2015, p. 141–161 (ISSN 1438-793X et 1438-7948, PMID 25722247, PMCID PMC4361730, DOI 10.1007/s10142-015-0433-4, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)

[8] H. Reichenbach, « Myxobacteria, producers of novel bioactive substances », Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology, vol. 27, n^o 3,‎ septembre 2001, p. 149–156 (ISSN 1367-5435, PMID 11780785, lire en ligne, consulté le 25 avril 2018)

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