RefSeq

RefSeq
Tipo	Base de datos de secuencias genómicas curadas y no redundantes
Sede central	Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI)
Sitio web	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq
[editar datos en Wikidata]

RefSeq (de The Reference Sequence en Inglés) es la base de datos pública de secuencias de ácidos nucleicos (ADN y ARN) y proteínas, anotadas y curadas, del Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI).^[1]​ RefSeq comenzó a funcionar en el año 2000^[2]​^[3]​ y, a diferencia de GenBank, solo ofrece un registro por cada biomolécula, ya sea ADN, ARN o proteína, para los organismos más relevantes desde virus hasta bacterias y eucariotas.

Para cada organismo modelo, RefSeq guarda registros separados y enlazados para el ADN genómico, los transcritos y las proteínas resultantes de estos. Esta base de datos está limitada a los organismos más importantes, para los que hay disponible la suficiente información (121 461 organismos diferentes a fecha de julio de 2022)^[4]​, mientras que GenBank incluye secuencias para cualquier organismo subido a la base de datos (aproximadamente 504 000 especies formalmente descritas).^[5]​

1. ↑ Pruitt, Kim D.; Tatusova, Tatiana; Maglott, Donna R. (1 de enero de 2005). «NCBI Reference Sequence (RefSeq): a curated non-redundant sequence database of genomes, transcripts and proteins». Nucleic Acids Research 33 (Database issue): D501-504. ISSN 1362-4962. PMID 15608248. doi:10.1093/nar/gki025. Consultado el 22 de julio de 2022. 
2. ↑ Maglott, D. R.; Katz, K. S.; Sicotte, H.; Pruitt, K. D. (1 de enero de 2000). «NCBI's LocusLink and RefSeq». Nucleic Acids Research 28 (1): 126-128. ISSN 0305-1048. PMID 10592200. doi:10.1093/nar/28.1.126. Consultado el 22 de julio de 2022. 
3. ↑ Pruitt, Kim D.; Katz, Kenneth S.; Sicotte, Hugues; Maglott, Donna R. (1 de enero de 2000). «Introducing RefSeq and LocusLink: curated human genome resources at the NCBI». Trends in Genetics (en inglés) 16 (1): 44-47. ISSN 0168-9525. PMID 10637631. doi:10.1016/S0168-9525(99)01882-X. Consultado el 22 de julio de 2022. 
4. ↑ «RefSeq Release 213 Statistics (Report)». ftp.ncbi.nlm.nih.gov. 11 de julio de 2022. Consultado el 22 de julio de 2022. 
5. ↑ Sayers, Eric W; Cavanaugh, Mark; Clark, Karen; Pruitt, Kim D; Schoch, Conrad L; Sherry, Stephen T; Karsch-Mizrachi, Ilene (7 de enero de 2022). «GenBank». Nucleic Acids Research 50 (D1): D161-D164. ISSN 0305-1048. doi:10.1093/nar/gkab1135. Consultado el 22 de julio de 2022.