Thaumarchaeota

Jak číst taxoboxThaumarchaeota
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
DoménaArchea
NadkmenProteoarcheota
KmenThaumarcheota
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Thaumarchaeota (též Nitrososphaerota[1]) je archeální kmen,[2] jehož vyčlenění z kmene Crenarchaeota bylo navrženo v roce 2008 na základě sekvenace genomu Cenarchaeum symbiosum.[3] Tato změna byla dále podpořena sekvenací genomů Nitrosopumilus maritimus a Nitrososphaera gargensis v roce 2010.[4] Jedná se o amoniak oxidující archea (AOA).[5] Specifickým znakem tohoto kmene je membránový lipid crenarchaeol, který se vyskytuje pouze u nich a skládá se z jednoho cyklohexanového a čtyř cyklopentanových kruhů. Předpokládá se, že umožňuje těmto organismům adaptaci na nižší teploty v oceánech, kde se často vyskytují.[6] Nejčastěji jsou studována jako obohacené směsné kultury, ale podařilo se získat i několik čistých kultur.[7] Kultivace je obtížná kvůli dlouhé době zdvojení, která může být 21 až 81 hodin.[8][9]

  1. WHITMAN, William B.; OREN, Aharon; CHUVOCHINA, Maria. Proposal of the suffix –ota to denote phyla. Addendum to ‘Proposal to include the rank of phylum in the International Code of Nomenclature of Prokaryotes’. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2018, roč. 68, čís. 3, s. 967–969. Dostupné online [cit. 2023-11-28]. ISSN 1466-5034. DOI 10.1099/ijsem.0.002593. 
  2. OREN, Aharon; GARRITY, George M. Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2021, roč. 71, čís. 10, s. 005056. Dostupné online [cit. 2023-11-19]. ISSN 1466-5034. DOI 10.1099/ijsem.0.005056. 
  3. BROCHIER-ARMANET, Céline; BOUSSAU, Bastien; GRIBALDO, Simonetta. Mesophilic crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota. Nature Reviews Microbiology. 2008-03, roč. 6, čís. 3, s. 245–252. Dostupné online [cit. 2023-11-19]. ISSN 1740-1534. DOI 10.1038/nrmicro1852. (anglicky) 
  4. SPANG, Anja; HATZENPICHLER, Roland; BROCHIER-ARMANET, Céline. Distinct gene set in two different lineages of ammonia-oxidizing archaea supports the phylum Thaumarchaeota. Trends in Microbiology. 2010-08, roč. 18, čís. 8, s. 331–340. PMID: 20598889. Dostupné online [cit. 2023-11-19]. ISSN 1878-4380. DOI 10.1016/j.tim.2010.06.003. PMID 20598889. 
  5. YIN, Zhixuan; BI, Xuejun; XU, Chenlu. Ammonia-Oxidizing Archaea (AOA) Play with Ammonia-Oxidizing Bacteria (AOB) in Nitrogen Removal from Wastewater. Archaea. 2018-09-13, roč. 2018, s. 8429145. PMID: 30302054 PMCID: PMC6158934. Dostupné online [cit. 2023-12-07]. ISSN 1472-3646. DOI 10.1155/2018/8429145. PMID 30302054. 
  6. DAMSTÉ, Jaap S. Sinninghe; SCHOUTEN, Stefan; HOPMANS, Ellen C. Crenarchaeol: the characteristic core glycerol dibiphytanyl glycerol tetraether membrane lipid of cosmopolitan pelagic crenarchaeota. Journal of Lipid Research. 2002-10, roč. 43, čís. 10, s. 1641–1651. PMID: 12364548. Dostupné online [cit. 2023-11-30]. ISSN 0022-2275. DOI 10.1194/jlr.m200148-jlr200. PMID 12364548. 
  7. KÖNNEKE, Martin; BERNHARD, Anne E.; DE LA TORRE, José R. Isolation of an autotrophic ammonia-oxidizing marine archaeon. Nature. 2005-09, roč. 437, čís. 7058, s. 543–546. Dostupné online [cit. 2023-12-03]. ISSN 1476-4687. DOI 10.1038/nature03911. (anglicky) 
  8. SCHOUTEN, Stefan; HOPMANS, Ellen C.; BAAS, Marianne. Intact Membrane Lipids of “ Candidatus Nitrosopumilus maritimus,” a Cultivated Representative of the Cosmopolitan Mesophilic Group I Crenarchaeota. Applied and Environmental Microbiology. 2008-04-15, roč. 74, čís. 8, s. 2433–2440. Dostupné online [cit. 2023-12-05]. ISSN 0099-2240. DOI 10.1128/AEM.01709-07. PMID 18296531. (anglicky) 
  9. MOSIER, Annika C.; LUND, Marie B.; FRANCIS, Christopher A. Ecophysiology of an ammonia-oxidizing archaeon adapted to low-salinity habitats. Microbial Ecology. 2012-11, roč. 64, čís. 4, s. 955–963. PMID: 22644483. Dostupné online [cit. 2023-12-03]. ISSN 1432-184X. DOI 10.1007/s00248-012-0075-1. PMID 22644483. 

© MMXXIII Rich X Search. We shall prevail. All rights reserved. Rich X Search