Nextstrain est une collaboration entre des chercheurs de Seattle, aux États-Unis[1] et de Bâle, en Suisse[2] qui fournit une collection d'outils open source pour visualiser la génétique impliquée dans la propagation des épidémies virales[3].
Son objectif est de soutenir les mesures de santé publique et la surveillance en facilitant la compréhension de la propagation et de l'évolution des agents pathogènes. La plateforme Nextstrain a été lancée en 2015[2]. Le code développé par Nextstrain est rendu accessible au public, via, par exemple, github.com et ses données sont disponibles et consultables sous une forme accessible via les pages du site Web[4].
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