Mutazioni (sostituzioni, delezioni, inserimenti) delle varianti Omicron BA.1, BA.2, BA.3, BA.4, BA.5[1][2][3] | |||||
---|---|---|---|---|---|
BA.1 | BA.2 | BA.3 | BA.4 | BA.5 | |
gene | aminoacido | aminoacido | aminoacido | aminoacido | aminoacido |
ORF1a | K856R | S135R | S135R | S135R | S135R |
S2083I | T842I | G1307S | del141/143 | T842I | |
del2084/2084 | G1307S | T3090I | T842I | G1307S | |
A2710T | L3027F | T3255I | G1307S | L3027F | |
T3255I | T3090I | P3395H | L3027F | T3090I | |
P3395H | L3201F | A3657V | T3090I | T3255I | |
del3674/3676 | T3255I | del3675/3677 | T3255I | P3395H | |
I3758V | P3395H | P3395H | del3675/3677 | ||
del3675/3677 | del3675/3677 | ||||
ORF1b | P314L | P314L | P314L | P314L | P314L |
I1566V | R1315C | I1566V | R1315C | R1315C | |
I1566 V | I1566 V | I1566 V | |||
T2163I | T2163I | T2163I | |||
Proteina S (Spike) | A67V | T19I | A67V | T19I | T19I |
del69/70 | L24S | del69/70 | L24S | L24S | |
T95I | del25/27 | T95I | del25/27 | del25/27 | |
G142D | G142D | G142D | del69/70 | del69/70 | |
del143/145 | V213G | del143/145 | G142D | G142D | |
N211I | G339D | G339D | V213G | V213G | |
del212 | S371F | S477N | G339D | G339D | |
ins214EPE | S373P | T478K | S371F | S371F | |
G339D | S375F | E484A | S373P | S373P | |
S371L | T376 A | Q493R | S375F | S375F | |
S373P | D405N | Q498R | T376 A | T376 A | |
S375F | R408S | N501Y | D405N | D405N | |
S477N | K417N | Y505H | R408S | R408S | |
T478K | N440K | D614G | K417N | K417N | |
E484A | S477N | H655Y | N440K | N440K | |
Q493R | T478K | N679K | L452R | L452R | |
G496S | E484A | P681H | S477N | S477N | |
Q498R | Q493R | D796Y | T478K | T478K | |
N501Y | Q498R | Q954H | E484A | E484A | |
Y505H | N501Y | N969K | F486V | F486V | |
T547K | Y505H | Q498R | Q498R | ||
D614G | D614G | N501Y | N501Y | ||
H655Y | H655Y | Y505H | Y505H | ||
N679K | N679K | D614G | D614G | ||
P681H | P681H | H655Y | H655Y | ||
D796Y | N764K | N679K | N679K | ||
N856K | D796Y | P681H | P681H | ||
Q954H | Q954H | N764K | N764K | ||
N969K | N969K | D796Y | D796Y | ||
L981F | Q954H | Q954H | |||
N969K | N969K | ||||
ORF3a | T223I | T223I | T223I | ||
Proteina E (involucro) | T9I | T9I | T9I | T9I | T9I |
Proteina M (membrana) | D3N | Q19E | Q19E | Q19E | D3G |
Q19E | A63T | A63T | A63T | Q19E | |
A63T | A63T | ||||
ORF6 | D61L | D61L | |||
ORF8 | S84L | S84L | S84L | S84L | S84L |
Proteina N (nucleocapside) | P13L | P13L | P13L | P13L | P13L |
del31/33 | del31/33 | del31/33 | del31/33 | del31/33 | |
R203K | R203K | R203K | P151S | R203K | |
G204R | G204R | G204R | R203K | G204R | |
S413R | S413R | G204R | S413R | ||
S413R | |||||
Legenda:
Sostituzioni, es.: A63T l’Alanina63 viene sostituita dalla Treonina Delezioni, es.: del31/33 la sequenza salta gli amminoacidi dalla posizione 31 alla 33 Inserimenti, es.:ins214EPE La tripletta EPE si inserisce in posizione 214 Sfondo giallo: adiacenti o All'interno del dominio di clavaggio della furina Sottolineate sfondo rosa le mutazioni nel dominio di legame del recettore |
La variante Omicron del SARS-CoV-2, chiamata lignaggio B.1.1.529, è la variante del coronavirus SARS-CoV-2 con la più alta prevalenza cumulativa globale nell'anno 2022.[1][4][5] Secondo la nomenclatura PANGO, comprende la riga B.1.1.529 (in Nextstrain 21M) con la principale sottovariante BA.1 (Nextstrain 21K) e altre sottovarianti.[2][4]
La variante Omicron è stata rilevata per la prima volta in Botswana in un campione raccolto il 9 novembre 2021. Uno dei primi a identificare la variante fu il virologo zimbabwese Sikhulile Moyo,[6] direttore del laboratorio, il 26 novembre 2021. L'Organizzazione Mondiale della Sanità l'ha classificata come VOC (Variant Of Concern: variante preoccupante) e nominata con la lettera greca omicron.[5] L'OMS, nel sequenziare la nomenclatura delle varianti, ha saltato le precedenti lettere ni e xi dell'alfabeto greco per evitare confusione con le somiglianze della parola inglese new (nuovo) e il cognome cinese Xi.[7]
Questa variante ha un numero insolitamente alto di mutazioni, molte delle quali sono nuove o colpiscono il peplomero, conosciuto come proteina spike. Queste caratteristiche rendono la variante Omicron preoccupante per quanto riguarda la sua trasmissibilità e l'efficacia del sistema immunitario o dei vaccini contro di essa. Sono state messe in atto a livello internazionale diverse restrizioni all'ingresso per i viaggiatori provenienti dai paesi in cui è stata rilevata, al fine di limitarne la diffusione. Nonostante ciò, la variante era presente in tutto il mondo a metà dicembre, diffondendosi a un ritmo senza precedenti secondo l'OMS e ECDC.[8][9]
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