Microbioom

In de mond, op de huid en in de darmen komen zeer verschillende gemeenschappen van micro-organismen voor. Deze commensale bacteriën en andere microben oefenen een belangrijke invloed uit op de algehele lichaamsfysiologie.

Het microbioom is het geheel aan micro-organismen dat zich in een bepaalde omgeving bevindt.^[1] De term wordt meestal gebruikt om te verwijzen naar alle micro-organismen die van nature samenleven met een plant of dier.^[2]^[3] Bekende voorbeelden van microbiomen zijn de darmflora in het menselijk lichaam, of de rhizosfeer rond het wortelstelsel van een plant. Een microbioom is zeer complex en bestaat uit diverse levensvormen; voornamelijk bacteriën, maar ook archaea, schimmels en kleine protisten.^[2]

De lichamen van dieren en planten zijn de woonplaats van miljarden micro-organismen. Slechts een klein deel hiervan is ziekteverwekkend; de overgrote meerderheid leeft ongemerkt mee in of op de organen van de gastheer (commensalisme). De microben vervullen belangrijke functies, zoals de vertering van voedsel, productie van vitaminen en bescherming tegen kolonisatie van echte ziekteverwekkers. In het menselijk lichaam bevinden veruit de meeste microben zich in de dikke darm, maar ook rond de genitaliën en bepaalde delen van de huid.^[2]

Het microbioom is een belangrijk onderzoeksthema in de medische wetenschap. Er zijn verbanden gevonden tussen de compositie (samenstelling) van het microbioom en bepaalde aandoeningen, zoals darmziekten, diabetes en overgewicht. Er is nog veel onduidelijk over hoe het microbioom de gezondheid precies beïnvloedt. Met behulp van moderne sequencing-technieken is men erachter gekomen dat de compositie dynamisch is: het kan snel veranderen onder invloed van omgevingsfactoren als beweging, voeding en medicatie.^[4]

↑ (en) Hine, R. (2019). A Dictionary of Biology, 8th. Oxford University Press. ISBN 978-0-19-882148-9.
↑ ^a ^b ^c (en) Berg G, Rybakova D, Fischer D, Cernava T, Vergès M. (2020). Microbiome definition re-visited: Old concepts and new challenges. Microbiome 8 (1). PMID 32605663. PMC 7329523. DOI: 10.1186/s40168-020-00875-0.
↑ (en) Turner T, James E, Poole P. (2013). The plant microbiome. Genome Biology 14 (209). DOI: 10.1186/gb-2013-14-6-209.
↑ (en) Malard F, Dore J, Gaugler B, Mohty M. (2020). Introduction to host microbiome symbiosis in health and disease. Mucosal Immunology volume 14: 547–554. DOI: 10.1038/s41385-020-00365-4.

[1] (en) Hine, R. (2019). A Dictionary of Biology, 8th. Oxford University Press. ISBN 978-0-19-882148-9.

[Berg2020-2] (en) Berg G, Rybakova D, Fischer D, Cernava T, Vergès M. (2020). Microbiome definition re-visited: Old concepts and new challenges. Microbiome 8 (1). PMID 32605663. PMC 7329523. DOI: 10.1186/s40168-020-00875-0.

[3] (en) Turner T, James E, Poole P. (2013). The plant microbiome. Genome Biology 14 (209). DOI: 10.1186/gb-2013-14-6-209.

[4] (en) Malard F, Dore J, Gaugler B, Mohty M. (2020). Introduction to host microbiome symbiosis in health and disease. Mucosal Immunology volume 14: 547–554. DOI: 10.1038/s41385-020-00365-4.

[1]

[2]

[3]

[4]