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FASTA
| Développé par | William R. Pearson |
|---|---|
| Dernière version | 36.3.5 () |
| Dépôt | github.com/wrpearson/fasta36 |
| Écrit en | C |
| Système d'exploitation | Type Unix, Linux, Microsoft Windows et macOS |
| Environnement | UNIX, Linux, Windows, Mac OS X |
| Type | Bioinformatique |
| Licence | Libre pour un usage académique |
| Site web | fasta.bioch.virginia.edu |
FASTA est à l'origine un programme d'alignement de séquences d'ADN et de protéine développé par William R. Pearson en 1988[1]. Au fil de son développement, il est devenu une suite de programmes, étendant ainsi ses possibilités en termes d'alignement. FASTA est le descendant du programme FASTP publié par David J. Lipman et William R. Pearson en 1985[2]. Un des héritages de ce programme est le format de fichier FASTA qui est devenu un format standard en bioinformatique.
- (en) Pearson WR. & Lipman DJ., « Improved tools for biological sequence comparison. », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 85, no 8, , p. 2444-8 (ISSN 0027-8424, PMID 3162770, DOI 10.1073/pnas.85.8.2444)
- (en) Lipman DJ. & Pearson WR., « Rapid and sensitive protein similarity searches. », Science (New York, N.Y.), vol. 227, no 4693, , p. 1435-41 (ISSN 0036-8075, PMID 2983426, DOI 10.1126/science.2983426)
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